Стэнфордское исследование показало, что диета, состоящая из ферментированных продуктов, увеличивает разнообразие микробиомы и снижает воспаление.
Исследователи из Стэнфорда обнаружили, что 10-недельная диета с высоким содержанием ферментированных продуктов увеличивает разнообразие микробиомы и улучшает иммунные реакции.
Натуральные оливки – это пробиотические продукты (оливки в металлических или стеклянных банках – нет).
12 ИЮЛЯ 2021 р
Исследователи из Стэнфорда обнаружили, что употребление диеты с высоким содержанием ферментированных продуктов, таких как кимчи, увеличивает разнообразие кишечных микробов, что связано с улучшением здоровья.
По словам исследователей из Стэнфордской школы медицины, диета, богатая ферментированными продуктами, увеличивает разнообразие кишечных микробов и снижает молекулярные признаки воспаления.
В ходе клинического исследования 36 здоровых взрослых людей были случайно распределены на 10-недельную диету, включавшую либо ферментированные продукты, либо продукты с высоким содержанием клетчатки. Две диеты по-разному влияли на микробиом кишечника и иммунную систему.
Употребление таких продуктов, как йогурт, кефир, ферментированный сыр, кимчи и другие ферментированные овощи, овощные разсольные напитки и чайный гриб, привело к увеличению общего микробного разнообразия с более сильным эффектом от больших порций. "Это потрясающее открытие", - сказал Джастин Зонненбург, доктор философии, доцент микробиологии и иммунологии. «Это один из первых примеров того, как простое изменение диеты может воспроизводиться реконструировать микробиоту в когорте здоровых взрослых».
Кроме того, четыре типа иммунных клеток показали меньшую активацию группы ферментированных продуктов. Уровни 19 воспалительных белков, измеренных в образцах крови, также снизились. Один из этих белков, интерлейкин 6, связан с такими состояниями как ревматоидный артрит, диабет типа 2 и хронический стресс.
"Диеты, нацеленные на микробиот, могут изменить иммунный статус, обеспечивая перспективный путь уменьшения воспаления у здоровых взрослых", - сказал Кристофер Гарднер, доктор философии, профессор Ренборг Фаркуар и директор по исследованиям питания в Стэнфордском исследовательском центре профилактики. "Этот результат был одинаков для всех участников исследования, которые были отнесены к группе продуктов с высоким содержанием ферментации".
Важно понимать, как вирусы, обитающие в кишечнике, влияют на здоровье человека. Дисбаланс микробиомы кишечника может способствовать возникновению таких заболеваний и состояний, как ожирение, воспалительные заболевания кишечника и аллергии. Необходимо понять роль наших кишечных бактерий и заражающих их бактериофагов в здоровье и болезнях человека. В настоящее время исследователи из Института Велком Сенгер и Европейского института биоинформатики EMBL (EMBL-EBI) сообщают, что они идентифицировали 140 000 видов вирусов, обитающих в кишечнике человека, более половины из которых никогда раньше не встречались.
Их результаты "Массовое расширение разнообразия кишечных бактериофагов человека" были опубликованы в журнале Cell.
"Бактериофаги управляют эволюционными изменениями в бактериальных сообществах, создавая сети потоков генов, подпитывающих экологические адаптации", - пишут исследователи. Однако степень вирусного разнообразия и его распространенность в кишечнике человека остаются в значительной степени неизвестными. Здесь мы представляем базу данных кишечных фагов (GPD), коллекцию из ~ 142 000 неизбыточных вирусных геномов (>10 т.п.н.), полученных путем извлечения данных из 28 060 глобально распределенных метагеномов кишечника человека и 2898 эталонных геномов.
Используя метагеномику, исследователи изучили и каталогизировали биоразнообразие вирусных видов, обнаруженных в 28 060 общедоступных метагеномах кишечника человека и 2898 геномах бактериальных изолятов, культивируемых из кишечника человека.
"Важно помнить, что не все вирусы вредны, но являются неотъемлемым компонентом экосистемы кишечника", - объяснил Александр Алмейда, доктор философии, постдокторант в EMBL-EBI и Институте Wellcome Sanger. «Во-первых, большинство обнаруженных нами вирусов имеют ДНК как генетический материал, отличающийся от патогенов, известных большинству людей, таких как SARS-CoV-2 или Zika, являющиеся РНК-вирусами. Во-вторых, эти образцы поступали в основном от здоровых людей, не имеющих конкретных заболеваний. Удивительно наблюдать, как многие неизвестные виды живут в нашем кишечнике, и пытаться выяснить связь между ними и здоровьем человека».
Была идентифицирована группа вирусов, которые, как полагают, имели общий предок, которую исследователи называют губафагом. Было обнаружено, что это второй по распространенности сокровища вирусов в кишечнике человека после crAssphage, обнаруженного в 2014 году.
Похоже, что оба этих вируса инфицируют аналогичные типы кишечных бактерий человека, но без дальнейших исследований трудно узнать точные функции недавно открытого губафага.
«Важным аспектом нашей работы было обеспечение высочайшего качества реконструированных вирусных геномов», – добавил Луис Ф. Камарилло-Герреро, аспирант Института Велком Сенгер и первый автор исследования. «Суровый конвейер контроля качества в сочетании с подходом машинного обучения позволили нам снизить риск заражения и получить высокополные вирусные геномы. Высококачественные вирусные геномы открывают путь к лучшему пониманию роли вирусов в микробиоме кишечника, включая открытие новых методов лечения, таких как противомикробные препараты бактериофагового происхождения.
Результаты исследования составляют основу GPD, которая станет источником информации для изучающих бактериофаги и роль, которую они играют в регулировании здоровья как наших кишечных бактерий, так и нас самих.
«Исследования бактериофагов сейчас переживают ренессанс. Этот высококачественный крупномасштабный каталог вирусов кишечника человека является своевременным, чтобы быть планом для проведения экологического и эволюционного анализа в будущих исследованиях веры», – отметил Тревор Лоули, старший автор исследования из Института Wellcome Sanger.
«… Мы считаем, что дальнейшая характеристика других выдающихся генетических элементов, таких как ICE, интегративные мобилизованные элементы (IME), генетические острова и транспозоны, приблизит нас к пониманию связи микробиома кишечника с разным образом жизни, возрастом и, наконец, здоровьем. я и болезнь», – заключили исследователи.
Источник: Genetic Engineering and Biotechnology News
